CentOS R 安装
1. 前提条件
在开始安装R之前,确保你的CentOS系统满足以下基本要求:
操作系统版本:CentOS 7或更高版本。
内存:至少1GB的RAM(建议更多以便流畅运行)。
权限:你需要有sudo权限的用户身份登录。
2. 自动安装R语言
R语言可以通过EPEL(Extra Packages for Enterprise Linux)仓库进行安装,以下是详细步骤:
启用EPEL和PowerTools软件源:
sudo yum install epelrelease sudo dnf configmanager setenabled PowerTools
安装R:
sudo yum install R
验证安装:
你可以通过打印R版本来确认安装是否成功:
R version
这将显示已安装的R版本信息。
3. 手动编译安装R语言
如果你需要安装特定版本的R或者CentOS版本较低时,可以手动编译安装,以下是详细步骤:
安装依赖库:
sudo yum groupinstall "Development Tools" sudo yum install readlinedevel libXtdevel libX11devel libXmudevel libXidevel ncursesdevel texinfo openssldevel libjpegdevel libpngdevel libtiffdevel
下载并解压R源码包:
安装R 4.1.0版本:
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R4/R4.1.0.tar.gz sudo tar zxf R4.1.0.tar.gz cd R4.1.0
配置和编译:
sudo ./configure enableRshlib=yes withlibpngx=no withtcltk prefix=/usr/bin/R sudo make sudo make install
修改环境配置文件:
echo 'R_HOME=/usr/bin/R' >> /etc/profile echo 'PATH=$PATH:$R_HOME/bin' >> /etc/profile source /etc/profile
通过上述步骤,你可以成功安装R语言。
4. 安装Rstudioserver
Rstudio是一个强大的集成开发环境,可以在服务器上通过Rstudioserver使用,以下是详细步骤:
下载Rstudioserver:
根据你的CentOS版本选择相应的Rstudioserver版本,对于CentOS 8:
wget https://download2.rstudio.org/server/centos8/x86_64/rstudioserverrhel1.4.1106x86_64.rpm sudo yum y install rstudioserverrhel1.4.1106x86_64.rpm
启动并配置Rstudioserver:
编辑配置文件:
sudo vim /etc/rstudio/rserver.conf
添加以下内容:
wwwport = 8787 rsessionwhichr=/usr/bin/R authtimeoutminutes=0 authstaysignedindays=30
同样,编辑/etc/rstudio/rsession.conf
文件,添加:
wwwport = 8787
保存并退出,然后启动Rstudioserver:
sudo systemctl start rstudioserver
设置防火墙:
为了允许外部访问,需要开放8787端口:
sudo firewallcmd zone=public addport=8787/tcp permanent sudo firewallcmd reload
你可以通过浏览器访问http://your_server_ip:8787
来使用Rstudioserver。
FAQs
问题1:如何在CentOS 8上安装最新版本的R?
答案:要在CentOS 8上安装最新版本的R,请按照以下步骤操作:
1、启用EPEL和PowerTools软件源:
```bash
sudo dnf install epelrelease
sudo dnf configmanager setenabled PowerTools
```
2、安装R:
```bash
sudo yum install R
```
3、验证安装:
```bash
R version
```
这将显示已安装的R版本信息,如果需要更新到最新版本,可以从CRAN官网下载相应版本的源码包,手动编译安装。
问题2:如何解决Rstudioserver无法启动的问题?
答案:如果Rstudioserver无法启动,可以尝试以下步骤进行排查和解决:
1、检查日志文件:查看/var/log/rstudioserver/rserver.log
和/var/log/rstudioserver/rsessionlauncher.log
中的日志信息,找出可能的错误原因。
2、检查配置文件:确保/etc/rstudio/rserver.conf
和/etc/rstudio/rsession.conf
文件中的配置正确无误,特别是wwwport
和rsessionwhichr
路径是否正确。
3、检查依赖关系:确保所有必要的依赖库已经安装,可以使用以下命令安装缺失的依赖:
```bash
sudo yum install gcc gccc++ make autoconf automake libtool openssldevel libjpegdevel libXtdevel libX11devel libXmudevel libXidevel ncursesdevel texinfo readlinedevel Rdevel
```
4、防火墙设置:确保防火墙已经开放了Rstudioserver使用的端口(默认是8787),可以使用以下命令开放端口:
```bash
sudo firewallcmd zone=public addport=8787/tcp permanent
sudo firewallcmd reload
```
5、SELinux设置:如果启用了SELinux,可能需要将其设置为宽松模式或禁用,编辑/etc/sysconfig/selinux
文件,将SELINUX=enforcing
改为SELINUX=permissive
或SELINUX=disabled
,然后重启系统,注意,这可能会带来安全风险,因此仅用于排查问题。