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如何在CentOS上安装R语言环境?

CentOS R 安装

1. 前提条件

在开始安装R之前,确保你的CentOS系统满足以下基本要求:

如何在CentOS上安装R语言环境?-图1
(图片来源网络,侵权删除)

操作系统版本:CentOS 7或更高版本。

内存:至少1GB的RAM(建议更多以便流畅运行)。

权限:你需要有sudo权限的用户身份登录。

2. 自动安装R语言

R语言可以通过EPEL(Extra Packages for Enterprise Linux)仓库进行安装,以下是详细步骤:

启用EPEL和PowerTools软件源

如何在CentOS上安装R语言环境?-图2
(图片来源网络,侵权删除)
sudo yum install epelrelease
sudo dnf configmanager setenabled PowerTools

安装R

sudo yum install R

验证安装

你可以通过打印R版本来确认安装是否成功:

R version

这将显示已安装的R版本信息。

3. 手动编译安装R语言

如果你需要安装特定版本的R或者CentOS版本较低时,可以手动编译安装,以下是详细步骤:

如何在CentOS上安装R语言环境?-图3
(图片来源网络,侵权删除)

安装依赖库

sudo yum groupinstall "Development Tools"
sudo yum install readlinedevel libXtdevel libX11devel libXmudevel libXidevel ncursesdevel texinfo openssldevel libjpegdevel libpngdevel libtiffdevel

下载并解压R源码包

安装R 4.1.0版本:

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R4/R4.1.0.tar.gz
sudo tar zxf R4.1.0.tar.gz
cd R4.1.0

配置和编译

sudo ./configure enableRshlib=yes withlibpngx=no withtcltk prefix=/usr/bin/R
sudo make
sudo make install

修改环境配置文件

echo 'R_HOME=/usr/bin/R' >> /etc/profile
echo 'PATH=$PATH:$R_HOME/bin' >> /etc/profile
source /etc/profile

通过上述步骤,你可以成功安装R语言。

4. 安装Rstudioserver

Rstudio是一个强大的集成开发环境,可以在服务器上通过Rstudioserver使用,以下是详细步骤:

下载Rstudioserver

根据你的CentOS版本选择相应的Rstudioserver版本,对于CentOS 8:

wget https://download2.rstudio.org/server/centos8/x86_64/rstudioserverrhel1.4.1106x86_64.rpm
sudo yum y install rstudioserverrhel1.4.1106x86_64.rpm

启动并配置Rstudioserver

编辑配置文件:

sudo vim /etc/rstudio/rserver.conf

添加以下内容:

wwwport = 8787
rsessionwhichr=/usr/bin/R
authtimeoutminutes=0
authstaysignedindays=30

同样,编辑/etc/rstudio/rsession.conf文件,添加:

wwwport = 8787

保存并退出,然后启动Rstudioserver:

sudo systemctl start rstudioserver

设置防火墙

为了允许外部访问,需要开放8787端口:

sudo firewallcmd zone=public addport=8787/tcp permanent
sudo firewallcmd reload

你可以通过浏览器访问http://your_server_ip:8787来使用Rstudioserver。

FAQs

问题1:如何在CentOS 8上安装最新版本的R?

答案:要在CentOS 8上安装最新版本的R,请按照以下步骤操作:

1、启用EPEL和PowerTools软件源:

```bash

sudo dnf install epelrelease

sudo dnf configmanager setenabled PowerTools

```

2、安装R:

```bash

sudo yum install R

```

3、验证安装:

```bash

R version

```

这将显示已安装的R版本信息,如果需要更新到最新版本,可以从CRAN官网下载相应版本的源码包,手动编译安装。

问题2:如何解决Rstudioserver无法启动的问题?

答案:如果Rstudioserver无法启动,可以尝试以下步骤进行排查和解决:

1、检查日志文件:查看/var/log/rstudioserver/rserver.log/var/log/rstudioserver/rsessionlauncher.log中的日志信息,找出可能的错误原因。

2、检查配置文件:确保/etc/rstudio/rserver.conf/etc/rstudio/rsession.conf文件中的配置正确无误,特别是wwwportrsessionwhichr路径是否正确。

3、检查依赖关系:确保所有必要的依赖库已经安装,可以使用以下命令安装缺失的依赖:

```bash

sudo yum install gcc gccc++ make autoconf automake libtool openssldevel libjpegdevel libXtdevel libX11devel libXmudevel libXidevel ncursesdevel texinfo readlinedevel Rdevel

```

4、防火墙设置:确保防火墙已经开放了Rstudioserver使用的端口(默认是8787),可以使用以下命令开放端口:

```bash

sudo firewallcmd zone=public addport=8787/tcp permanent

sudo firewallcmd reload

```

5、SELinux设置:如果启用了SELinux,可能需要将其设置为宽松模式或禁用,编辑/etc/sysconfig/selinux文件,将SELINUX=enforcing改为SELINUX=permissiveSELINUX=disabled,然后重启系统,注意,这可能会带来安全风险,因此仅用于排查问题。

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