CentOS在科研中的应用
背景介绍
CentOS（Community Enterprise Operating System）是一个基于Red Hat Enterprise Linux (RHEL) 的开源操作系统，它在科研领域的应用广泛，涵盖了从高性能计算、数据分析到模拟仿真等多个方面，本文将详细介绍如何在CentOS上搭建一个适合科研的环境，包括操作系统的安装、基本配置以及常用软件的安装和使用。
一、准备工作
下载必要的软件和材料
U盘：容量700MB以上，用于制作启动盘。
CentOS镜像文件：从CentOS官网或其他可信来源下载最新版本的ISO镜像文件。
Universal USB installer：Windows下的启动盘制作工具。
一台已安装Windows的电脑：用于制作启动盘。
制作启动盘
运行Universal USB installer并选择CentOS的ISO镜像文件。
按照提示完成启动盘的制作。
二、安装CentOS
启动计算机并进入BIOS
重启计算机，进入BIOS设置，选择从U盘启动。
开始安装
进入CentOS的LiveCD环境后，点击桌面的“Install to Hard Drive”开始安装。
选择安装过程中使用的语言（建议使用英语）。
选择区域和城市（例如Asia和Shanghai）。
键盘布局选择English (US)。
Hostname可以改也可以不改，例如设置为saturn.geolab。
分区设置
选择要使用的硬盘，并在“Other Storage Options”处选择“I will configure partioning”，即手动分区。
点击“Click here to create them automatically”，让安装程序帮忙分区。
根据需要手动修改分区细节：
/boot：自动分配，不要乱改。
/：根目录，建议30GB以上。
swap：与物理内存大小一致。
/opt：用于第三方软件，建议70GB。
/home：余下的全部空间。
完成安装
设置Root密码并创建一个一般用户。
等待安装完成后，重启系统。
三、系统配置
更新系统
sudo yum update y
添加第三方源
为了确保系统的稳定性，可以添加EPEL、Nux Dextop和ELRepo源。
EPEL
sudo yum install epelrelease y
Nux Dextop
sudo rpm Uvh http://li.nux.ro/download/nux/dextop/el7/x86_64/nuxdextoprelease05.el7.nux.noarch.rpm
ELRepo
sudo rpm import https://www.elrepo.org/RPMGPGKEYelrepo.org sudo rpm Uvh http://www.elrepo.org/elreporelease7.02.el7.elrepo.noarch.rpm
安装常用软件
Git
sudo yum install git y
或通过ius仓库安装最新版本：
sudo yum install https://ius.io/setup.rpm y sudo yum install git2u y
远程管理工具Putty
sudo yum install putty y
SSH服务配置
sudo systemctl enable sshd sudo systemctl start sshd
配置SSH无密码登录：
sshkeygen t rsa sshcopyid user@remote_host
四、科研相关软件安装与配置
以下是一些常见的科研软件及其安装方法：
MATLAB
MATLAB是一款广泛应用于数据分析和仿真的商用软件，可以通过以下步骤安装：
sudo su mkdir /opt/matlab mount o loop /path/to/matlab.iso /media/cdrom cp rpl /media/cdrom /opt/matlab umount /media/cdrom /opt/matlab/install
按照提示完成安装，并配置好环境变量。
Cadence IC设计套件
Cadence是IC设计的行业标准软件套件，安装步骤如下：
sudo mkdir p /opt/cadence/installscape sudo mkdir p /opt/mentor/Calibre2015
下载并解压软件包，然后按照官方文档进行安装和配置。
五、常见问题及解决
1. CentOS中新建用户后文件有锁标志无法修改
这是由于root权限下下载的文件默认属于root用户，可以通过以下命令更改文件所有权：
sudo chown username:groupname filename
或者递归更改整个目录的所有权：
sudo chown R username:groupname directory/
SSH无密码登录配置问题
确保在本地和远程机器上都生成了SSH密钥对，并将公钥复制到远程机器的~/.ssh/authorized_keys文件中，如果仍然无法无密码登录，检查文件权限：
chmod 600 ~/.ssh/authorized_keys chmod 700 ~/.ssh
六、归纳
通过以上步骤，您可以在CentOS上搭建一个稳定且高效的科研环境，无论是数据分析、高性能计算还是IC设计，CentOS都提供了强大的支持，希望本文对您有所帮助，祝您在科研工作中取得更大的成就！
