在CentOS上安装R语言及其集成开发环境RStudioserver，可以通过以下步骤进行，以下是详细的安装指南：
一、安装R语言
1. 启用EPEL和PowerTools软件源
首先需要启用EPEL和PowerTools软件源，因为R语言的官方包并不包含在默认的CentOS软件源中。
- sudo dnf install epelrelease
- sudo dnf configmanager setenabled PowerTools
2. 安装R语言
通过yum命令安装R语言：
- sudo yum install R
3. 验证安装过程
打印R版本以确认安装成功：
- R version
R最稳定的版本是3.6.2：
- R version 3.6.2 (20191212) "Dark and Stormy Night"
- Copyright (C) 2019 The R Foundation for Statistical Computing
- Platform: x86_64redhatlinuxgnu (64bit)
- R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
- You are welcome to redistribute it under the terms of the
- GNU General Public License versions 2 or 3.
- For more information about these matters see
- https://www.gnu.org/licenses/.
4. 安装必要的库和工具
为了能够顺利安装R包，还需要安装一些额外的库和工具：
- sudo yum install make gcc gccc++ libcurldevel libxml2devel openssldevel texlive
至此，你已经在centos系统上成功安装了R语言，可以开始使用它了。
二、安装RStudioserver
1. 下载RStudioserver
访问RStudio官网，找到并选择DOWNLOAD SERVER选项，然后下载适用于CentOS的RStudioserver安装包，可以使用wget命令直接下载：
- wget https://download2.rstudio.org/server/centos7/x86_64/rstudioserverrhel2021.09.1372x86_64.rpm
2. 安装RStudioserver
使用yum命令安装下载好的RStudioserver包：
- sudo yum install rstudioserverrhel2021.09.1372x86_64.rpm
3. 开启8787端口
CentOS 7系统采用新的防火墙策略，安装完成Rstudio之后，还不能通过浏览器访问，需要进行防火墙设置才行：
- systemctl enable rstudioserver.service
- systemctl start rstudioserver.service
- systemctl status rstudioserver
- firewalld
- firewallcmd permanent addport=8787/tcp
- firewallcmd permanent addport=8787/udp
- firewallcmd reload
4. 编辑rstudioserver配置文件
编辑RStudioserver的配置文件以确保其正确运行：
- vi /etc/rstudio/rserver.conf
添加如下配置：
- Server Configuration File
- wwwport=8787
- rsessionwhichr=/usr/local/bin/R
- vi /etc/rstudio/rsession.conf
添加如下配置：
- R Session Configuration File
- sessiontimeoutminutes=0
三、安装R包
1. 安装常用R包
在R终端中，可以使用install.packages()函数来安装所需的R包。
- install.packages("stringr")
你将会被询问选择一个CRAN镜像，选择一个最靠近你位置的镜像即可。
2. 安装Bioconductor包
对于Bioconductor包，可以先安装BiocManager，然后通过它来安装所需的Bioconductor包：
- if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) {
- install.packages("BiocManager")
- }
- BiocManager::install("clusterProfiler")
3. 设置镜像源
为了加快包的下载速度，可以设置镜像源为清华大学的镜像：
- options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
- options(repos = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
1. 归纳
步骤详细描述了如何在CentOS上安装R语言及其集成开发环境RStudioserver，通过这些步骤，你可以顺利地在服务器上搭建一个R语言的开发环境，并通过RStudioserver进行远程访问和管理，这对于数据分析和统计计算非常有帮助。
2. FAQs
Q1: 如果在安装过程中遇到依赖问题怎么办？
A1: 如果遇到依赖问题，可以尝试手动安装缺失的依赖包，如果缺少libjpegdevel，可以使用以下命令安装：
- sudo yum install libjpegdevel
然后重新尝试安装R或R包。
Q2: 如何更改RStudioserver的默认端口号？
A2: 要更改RStudioserver的默认端口号（8787），可以在/etc/rstudio/rserver.conf文件中修改wwwport参数，要将端口改为8788，可以这样设置：
- wwwport=8788
然后重启RStudioserver服务：
- sudo systemctl restart rstudioserver.service
