在CentOS系统中安装R语言,可以通过系统命令直接安装或通过源码编译安装,以下是详细的步骤和说明:
使用系统命令安装R
1. 安装EPEL仓库
在CentOS中,可以使用yum命令来安装R,但首先需要确保安装了EPEL(Extra Packages for Enterprise Linux)仓库:
sudo yum install epelrelease y
2. 安装R
安装EPEL仓库后,可以使用以下命令安装R:
sudo yum install R y
这种方法简单方便,但可能无法安装到最新版本的R,在CentOS 7的软件源中,R的版本为3.6。
源码编译安装R
如果需要安装特定版本的R或者最新版本的R,可以选择源码编译安装。
1. 安装依赖
在编译R之前,需要先安装一些必要的依赖库:
sudo yum install y zlib java gccgfortran gcc gccc++ readlinedevel libXtdevel bzip2devel libpngdevel libjpegdevel libtiffdevel libcairodevel cairodevel
2. 下载并解压R源码
从CRAN(Comprehensive R ARChive Network)下载所需版本的R源码包,然后解压:
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R4/R4.1.2.tar.gz tar zxvf R4.1.2.tar.gz cd R4.1.2
3. 配置、编译和安装
运行configure脚本检查依赖并进行配置,然后编译和安装:
./configure enableRshlib withpcre1 make j4 sudo make install
注意:在配置过程中,如果缺少某些依赖,configure脚本会提示错误信息,需要根据提示安装相应的依赖库。
设置环境变量
为了使系统能够找到新安装的R,需要设置环境变量,编辑~/.bashrc文件,添加以下内容:
export PATH=/usr/local/R/bin:$PATH
保存文件后,执行source ~/.bashrc使更改生效。
验证安装
在终端输入R,如果出现R版本信息,则表示安装成功,要退出R,可以输入q()。
安装RStudio Server(可选)
RStudio是R的集成开发环境,可以在服务器端安装RStudio Server,以便通过浏览器访问RStudio,下载最新版RStudio Server并安装:
sudo yum install rstudioserverrhel2021.09.1372x86_64.rpm
开启8787端口以允许外部访问:
firewallcmd permanent addport=8787/tcp firewallcmd permanent addport=8787/udp firewallcmd reload
FAQs(常见问题解答)
问题1:如何在CentOS上安装特定版本的R?
答:可以通过源码编译的方式来安装特定版本的R,首先从CRAN下载所需版本的R源码包,然后按照上述步骤进行依赖安装、源码解压、配置、编译和安装,在配置过程中,可以使用enableRshlib选项来启用动态链接库支持。
问题2:为什么在安装R时会出现“error: cannot compile a simple Fortran program”?
答:这个错误通常是由于缺少Fortran编译器gfortran导致的,解决方法是安装gfortran:
sudo yum install gccgfortran y
安装完成后,重新运行configure脚本进行配置。