CentOS 安装 R
R是一种广泛用于统计分析和数据挖掘的开源编程语言,由R基金会支持,在CentOS系统上安装R及其相关软件包,可以为用户提供强大的数据处理能力,本文将详细介绍如何在CentOS 7和CentOS 8上安装R,包括通过yum命令安装和源码编译安装两种方法,并介绍如何配置和使用Rstudioserver。
前提条件
在开始安装之前,请确保你的系统满足以下条件:
1、内存:至少1G RAM,如果内存不足,建议创建swap文件。
2、用户权限:你需要以具有sudo权限的用户身份登录。
CentOS 7 安装 R
3.1 使用yum命令安装
1、安装EPEL仓库:
```bash
sudo yum install epelrelease y
```
2、安装R:
```bash
sudo yum install R y
```
3、验证安装:输入R version
查看安装版本。
4、安装必要的R包:
```bash
R
install.packages("rms")
```
3.2 源码编译安装
1、安装依赖库:
```bash
sudo yum install y zlib java gccgfortran gcc gccc++ readlinedevel libXtdevel bzip2devel libpngdevel libjpegdevel libtiffdevel libcairodevel cairodevel
```
2、下载并解压R源码:
```bash
wget HTTPS://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R4/R4.1.2.tar.gz
tar zxvf R4.1.2.tar.gz
cd R4.1.2
```
3、配置并编译:
```bash
./configure enableRshlib withpcre1
make j4
sudo make install
```
4、设置环境变量:
```bash
export PATH=/usr/local/bin:$PATH
```
3.3 安装Rstudioserver
1、下载安装包:
```bash
wget https://download2.rstudio.org/server/centos7/x86_64/rstudioserverrhel2021.09.1372x86_64.rpm
sudo yum install rstudioserverrhel2021.09.1372x86_64.rpm
```
2、启动并配置服务:
```bash
sudo systemctl enable rstudioserver.service
sudo systemctl start rstudioserver.service
sudo systemctl status rstudioserver.service
```
3、设置防火墙:
```bash
sudo firewallcmd permanent addport=8787/tcp
sudo firewallcmd permanent addport=8787/udp
sudo firewallcmd reload
```
4、编辑配置文件:
```bash
sudo vi /etc/rstudio/rserver.conf
```
添加或修改如下内容:
```conf
wwwport=8787
rsessionwhichr=/usr/local/bin/R
```
5、重启服务:
```bash
sudo systemctl restart rstudioserver.service
```
CentOS 8 安装 R
4.1 使用dnf命令安装
1、启用EPEL和PowerTools软件源:
```bash
sudo dnf install epelrelease y
sudo dnf configmanager setenabled PowerTools
```
2、安装R:
```bash
sudo dnf install R y
```
3、验证安装:输入R version
查看安装版本。
4、安装R包:与CentOS 7类似,进入R终端后使用install.packages()
命令安装所需包。
4.2 从CRAN上安装R软件包
1、安装必要的库和工具:
```bash
sudo yum install make gcc gccc++ libcurldevel libXML2devel openssldevel texlive* y
```
2、安装R包:例如安装stringr
包:
```bash
R
install.packages("stringr")
library(stringr)
```
常见问题及解决方法
5.1 问题一:无法找到R软件包
原因:可能是由于DNS解析问题或镜像连接错误。
解决方法:检查网络连接,尝试更换镜像源,使用清华大学的镜像源:
sudo vim /etc/yum.repos.d/CentOSBase.repo
将其中的baseurl改为:
baseurl=https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/centos/$releasever/os/$basearch/
保存退出后运行:
sudo yum clean all && sudo yum makecache sudo yum install R y
5.2 问题二:安装过程中报错[Errno 226] No more mirrors to try & [Errno 14]HTTP Error 404 Not Found
原因:可能是yum源的问题或网络连接不稳定。
解决方法:更换yum源,参考上述方法,如果问题依旧,可以尝试手动下载R的rpm包进行本地安装。
在CentOS系统上安装R及其相关软件包,可以通过yum命令或源码编译两种方式实现,安装完成后,可以使用Rstudioserver进行图形化操作,提高用户体验,遇到问题时,可以参考本文提供的解决方法进行处理,希望本文能帮助你在CentOS系统上顺利安装和使用R。